超凈工作臺原理是在在特定的空間內,室內空氣經預過濾器初濾,由小型離心風機壓入靜壓箱,再經空氣高效過濾器二級過濾,從空氣高效過濾器出風面吹出的潔凈氣流具有一定的和均勻的斷面風速,可以排除工作區原來的空氣,將塵埃顆粒和生物顆粒帶走,以形成無菌的高潔凈的工作環境。
超凈臺使用壽命的長短與空氣的潔凈度有關。在溫帶地區超凈臺可在一般實驗室使用,然而在熱帶或亞熱帶地區,由大氣中含有量的花粉,或多粉塵的地區,超凈臺則宜放在較好的有雙道門的室內使用。任何情下不應將超凈臺的進風罩對著開敞的門或窗,以免影響濾清器的使用壽命。